Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TROQ12816 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TROQ12816 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TROQ12816 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TROQ12816 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TROQ12816 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TROQ12816 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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