Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
APOBRQ0VD83 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms