Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ABCC8Q09428 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ABCC8Q09428 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms