Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SCN1BQ07699 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms