Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHRNB3Q05901 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms