Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DSC2Q02487 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DSC2Q02487 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms