Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HSF1Q00613 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HSF1Q00613 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms