Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLTCQ00610 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLTCQ00610 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms