Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MPP1Q00013 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms