Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
RPS29P62273 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
RPS29P62273 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
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