Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UFM1P61960 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFM1P61960 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFM1P61960 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFM1P61960 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFM1P61960 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFM1P61960 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UFM1P61960 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
UFM1P61960 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms