Protein–RNA interactions for Protein: P61923

COPZ1, Coatomer subunit zeta-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ1P61923 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
COPZ1P61923 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms