Protein–RNA interactions for Protein: P57772

EEFSEC, Selenocysteine-specific elongation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEFSECP57772 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
EEFSECP57772 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms