Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
BACE1P56817 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BACE1P56817 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BACE1P56817 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
BACE1P56817 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BACE1P56817 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BACE1P56817 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms