Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GEMP55040 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GEMP55040 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GEMP55040 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms