Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FNTAP49354 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FNTAP49354 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FNTAP49354 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FNTAP49354 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FNTAP49354 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms