Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PTDSS1P48651 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms