Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ACADSBP45954 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms