Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CRATP43155 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CRATP43155 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CRATP43155 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CRATP43155 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms