Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MCAMP43121 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MCAMP43121 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms