Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CASP3P42574 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms