Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM5CP41229 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms