Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CHI3L1P36222 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms