Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ACTN2P35609 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms