Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 LYL1-203ENST00000590974 902 ntTSL 324.42■■□□□ 1.53e-6■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 LYL1-202ENST00000590120 1547 nt20.68■□□□□ 0.93e-6■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 SRPK2-212ENST00000482897 715 ntTSL 523.6■■□□□ 1.374e-9■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 SRPK2-211ENST00000482862 329 ntTSL 523.36■■□□□ 1.334e-9■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 SRPK2-206ENST00000465112 568 ntTSL 315.92■□□□□ 0.144e-9■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 SRPK2-203ENST00000460391 666 ntTSL 215.32■□□□□ 0.044e-9■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 SRPK2-204ENST00000462282 505 ntTSL 313.48□□□□□ -0.254e-9■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 SRPK2-202ENST00000393651 3650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.634e-9■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ARF3-205ENST00000536283 537 ntTSL 424.84■■□□□ 1.571e-18■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ARF3-206ENST00000539611 576 ntTSL 523.37■■□□□ 1.331e-18■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.311e-18■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.021e-18■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.324e-8■■□□□ 11.4
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GTF2F1P35269 ZNF692-226ENST00000533647 548 ntTSL 324.89■■□□□ 1.584e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF692-224ENST00000530986 595 ntTSL 423.14■■□□□ 1.294e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF692-219ENST00000496231 656 ntTSL 322.53■■□□□ 1.24e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF692-215ENST00000483791 681 ntTSL 320.21■□□□□ 0.834e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF692-221ENST00000497847 1031 ntTSL 220.21■□□□□ 0.834e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF692-214ENST00000483223 901 ntTSL 319.72■□□□□ 0.754e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF692-222ENST00000528141 576 ntTSL 418.34■□□□□ 0.534e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF692-223ENST00000530699 896 ntTSL 1 (best)18.3■□□□□ 0.524e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF692-230ENST00000534660 552 ntTSL 314.8□□□□□ -0.044e-21■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 FAM3C-203ENST00000426156 662 ntTSL 530.18■■■□□ 2.421e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 TRIP10-204ENST00000595319 776 ntTSL 525.42■■□□□ 1.661e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 TRIP10-211ENST00000600491 1493 ntTSL 224.49■■□□□ 1.511e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.361e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 FAM3C-202ENST00000412653 561 ntTSL 419.32■□□□□ 0.681e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PDAP1-202ENST00000426447 767 ntTSL 516.95■□□□□ 0.31e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 TRIP10-207ENST00000596673 586 ntTSL 316.78■□□□□ 0.281e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 TRIP10-205ENST00000596078 1010 ntTSL 513.94□□□□□ -0.181e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 XRCC2-201ENST00000359321 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.541e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.141e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PDAP1-203ENST00000488214 274 ntTSL 37.24□□□□□ -1.251e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 NAP1L4-203ENST00000430811 860 ntTSL 228.7■■■□□ 2.181e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.831e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 NAP1L4-213ENST00000526842 535 ntTSL 520.09■□□□□ 0.811e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 LENG8-AS1-203ENST00000448978 464 ntTSL 512.18□□□□□ -0.461e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 NAP1L4-221ENST00000534372 544 ntTSL 511.8□□□□□ -0.521e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 LENG8-AS1-202ENST00000429922 871 ntTSL 4 BASIC9.77□□□□□ -0.851e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 NAP1L4-219ENST00000531291 572 ntTSL 58.08□□□□□ -1.121e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 NAP1L4-216ENST00000528968 587 ntTSL 57.37□□□□□ -1.231e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 NAP1L4-217ENST00000529361 555 ntTSL 57.24□□□□□ -1.251e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 NAP1L4-202ENST00000399614 594 ntTSL 46.79□□□□□ -1.321e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.668e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.338e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF276-209ENST00000568295 2206 ntTSL 228.98■■■□□ 2.238e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.018e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.878e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 SBNO2-206ENST00000587673 1209 ntTSL 526.2■■□□□ 1.788e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 BTBD2-206ENST00000589200 858 ntTSL 525.88■■□□□ 1.738e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.688e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PEX10-205ENST00000508384 611 ntTSL 325.2■■□□□ 1.628e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PEX10-203ENST00000502666 653 ntTSL 325.12■■□□□ 1.618e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PEX10-207ENST00000514502 548 ntTSL 424.81■■□□□ 1.568e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PEX10-206ENST00000510434 907 ntTSL 324.64■■□□□ 1.548e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.458e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PEX10-208ENST00000515760 603 ntTSL 423.9■■□□□ 1.428e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.191e-15■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.168e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.138e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.128e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.941e-15■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.918e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-211ENST00000494437 976 ntTSL 320.73■□□□□ 0.918e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.818e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-209ENST00000476512 942 ntTSL 319.92■□□□□ 0.788e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.648e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 CAPZB-208ENST00000482808 660 ntTSL 217.72■□□□□ 0.438e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-210ENST00000491346 1116 ntTSL 517.71■□□□□ 0.438e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.418e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 CAPZB-207ENST00000459967 579 ntTSL 316.98■□□□□ 0.318e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 416.32■□□□□ 0.28e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.28e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.158e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.158e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.148e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 BTBD2-205ENST00000588395 352 ntTSL 515.44■□□□□ 0.068e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ZNF276-206ENST00000563983 3403 ntTSL 214.79□□□□□ -0.048e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 BTBD2-203ENST00000587742 559 ntTSL 514.76□□□□□ -0.058e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.078e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.318e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ACTR3C-204ENST00000478393 5697 ntTSL 1 (best)12.53□□□□□ -0.48e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 212.33□□□□□ -0.448e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.618e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.648e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PITPNA-204ENST00000573056 571 ntTSL 59.73□□□□□ -0.858e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.931e-15■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.18e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PITPNA-208ENST00000575895 591 ntTSL 47.31□□□□□ -1.248e-7■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 PABPN1-204ENST00000554062 589 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-8■■□□□ 11.4
GTF2F1P35269 JPT2-202ENST00000382710 962 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.315e-15■□□□□ 11.3
GTF2F1P35269 JPT2-205ENST00000562569 458 ntTSL 37.86□□□□□ -1.155e-15■□□□□ 11.3
GTF2F1P35269 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.931e-6■□□□□ 11.3
GTF2F1P35269 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.61e-6■□□□□ 11.3
GTF2F1P35269 ZNF131-205ENST00000504359 565 ntTSL 418.03■□□□□ 0.481e-6■□□□□ 11.3
GTF2F1P35269 ZNF131-216ENST00000510026 2599 ntTSL 514.5□□□□□ -0.091e-6■□□□□ 11.3
GTF2F1P35269 ZNF131-220ENST00000515326 1050 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.251e-6■□□□□ 11.3
GTF2F1P35269 ZNF131-212ENST00000509156 2063 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.51e-6■□□□□ 11.3
GTF2F1P35269 ZNF131-213ENST00000509341 572 ntTSL 511.37□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 11.3
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