Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PTPRBP23467 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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