Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCNA2P20248 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms