Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRIM21P19474 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms