Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXB9P17482 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXB9P17482 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms