Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
VPREB1P12018 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
VPREB1P12018 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms