Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLUP10909 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CLUP10909 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CLUP10909 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CLUP10909 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms