Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

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Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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PTPRFP10586 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPRFP10586 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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