Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRCP08575 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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PTPRCP08575 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRCP08575 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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