Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CYBBP04839 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CYBBP04839 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms