Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PPFIA4O75335 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms