Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TLX3O43711 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TLX3O43711 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TLX3O43711 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms