Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CACNA1GO43497 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1GO43497 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms