Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC11O43248 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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HOXC11O43248 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXC11O43248 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
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HOXC11O43248 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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HOXC11O43248 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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HOXC11O43248 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC11O43248 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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HOXC11O43248 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC11O43248 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC11O43248 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC11O43248 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC11O43248 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
HOXC11O43248 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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