Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHF1O43189 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHF1O43189 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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