Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QRK9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QRK9 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QRK9 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QRK9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QRK9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
J3QRK9 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
J3QRK9 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
J3QRK9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
J3QRK9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms