Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KRT87PA6NCN2 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms