Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ERGIC3Q9Y282 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms