Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CGGBP1Q9UFW8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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