Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC88CQ9P219 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms