Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SH3BP4Q9P0V3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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SH3BP4Q9P0V3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SH3BP4Q9P0V3 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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