Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KLRF1Q9NZS2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms