Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXP7

GIN1, Gypsy retrotransposon integrase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIN1Q9NXP7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GIN1Q9NXP7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms