Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCM2LQ9NUG4 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCM2LQ9NUG4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms