Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA4BQ9NPR2 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SEMA4BQ9NPR2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms