Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ8

TMEM27, Collectrin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM27Q9HBJ8 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TMEM27Q9HBJ8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TMEM27Q9HBJ8 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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